洁净室的空调净化系统应根据不同的洁净度等级分设。对β-内酰胺类、避孕药品、激素类、强毒微生物及抗肿瘤药品、放射性药品等的工作室，应设置空调净化系统，其排风口应安装高效过滤设备，以将这些药物的污染降至最低限度。合肥净化工程设备对于恒温恒湿工程的分设空调净化系统有着严格要求。

  对不同洁净度等级的洁净室，产生粉尘和有害气体的洁净室，被排介质毒性大的、有易燃易爆气体的岗位，应单独设局部排风系统。洁净室的通风换气工程的换风口应有防倒灌装置。

  送风、回风和排风的启闭应有连锁装置。

严格控制人流物流

  洁净室应设专用的人流、物流通道。人员应按净化工程规定的程序进入，并应严格控制人数。对于物料可在除去浮尘后拆去外包通过缓冲间或传递柜送入。

  不同洁净等级的洁净区物品则通过传递窗传送。中间站宜设在中心位置，以便缩短运送距离。洁净区内不设与本岗位无关的管道。

  充分利用上下或周围的技术夹层，所有公用管道、工艺管道的主干管均在技术夹层安装。

  穿越地面、隔墙的管道尽可能靠近使用点并敷设套管，套管内的管道不应有焊缝，管道与套管之间应有可叉的密封措施。进入洁净室的管道应为不锈钢材质。